Trước đây, M. marisrubri được xem là một phân loài của Macropharyngodon bipartitus với danh pháp là Macropharyngodon bipartitus marisrubri dựa trên kiểu màu của cá đực. Tuy nhiên, mẫu gốc của M. marisrubri khi đó là một cá thể đực chưa phát triển đầy đủ (vẫn còn các vệt đốm đen thay vì các dải sọc, và vẫn còn giữ lại màu cam của cá cái). Năm 2013, M. bipartitus marisrubri chính thức được công nhận là một loài hợp lệ, với danh pháp là M. marisrubri[2].